Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scd3Q99PL7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms