Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Cep41Q99NF3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cep41Q99NF3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms