Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vgll1Q99NC0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms