Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrrtQ99MR6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms