Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Nus1Q99LJ8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Nus1Q99LJ8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Nus1Q99LJ8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nus1Q99LJ8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Nus1Q99LJ8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Nus1Q99LJ8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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