Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp16Q99LG0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp16Q99LG0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms