Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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