Protein–RNA interactions for Protein: Q922Q2

Riok1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok1Q922Q2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Riok1Q922Q2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Riok1Q922Q2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Riok1Q922Q2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Riok1Q922Q2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Riok1Q922Q2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Riok1Q922Q2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Riok1Q922Q2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Riok1Q922Q2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Riok1Q922Q2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Riok1Q922Q2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Riok1Q922Q2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Riok1Q922Q2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Riok1Q922Q2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Riok1Q922Q2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Riok1Q922Q2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Riok1Q922Q2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riok1Q922Q2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riok1Q922Q2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riok1Q922Q2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riok1Q922Q2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riok1Q922Q2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riok1Q922Q2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riok1Q922Q2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riok1Q922Q2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riok1Q922Q2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riok1Q922Q2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riok1Q922Q2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Riok1Q922Q2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Riok1Q922Q2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Riok1Q922Q2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Riok1Q922Q2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Riok1Q922Q2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Riok1Q922Q2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Riok1Q922Q2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Riok1Q922Q2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms