Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Afg3l1Q920A7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms