Protein–RNA interactions for Protein: Q91WT4

Dnajc17, DnaJ homolog subfamily C member 17, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc17Q91WT4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Dnajc17Q91WT4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc17Q91WT4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms