Protein–RNA interactions for Protein: Q91W92

Cdc42ep1, Cdc42 effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep1Q91W92 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdc42ep1Q91W92 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc42ep1Q91W92 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms