Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SnrkQ8VDU5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SnrkQ8VDU5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SnrkQ8VDU5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SnrkQ8VDU5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SnrkQ8VDU5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SnrkQ8VDU5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SnrkQ8VDU5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SnrkQ8VDU5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SnrkQ8VDU5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SnrkQ8VDU5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SnrkQ8VDU5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SnrkQ8VDU5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SnrkQ8VDU5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SnrkQ8VDU5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SnrkQ8VDU5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SnrkQ8VDU5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SnrkQ8VDU5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SnrkQ8VDU5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SnrkQ8VDU5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SnrkQ8VDU5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SnrkQ8VDU5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SnrkQ8VDU5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms