Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Fyco1Q8VDC1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Fyco1Q8VDC1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Fyco1Q8VDC1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms