Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sgip1Q8VD37 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms