Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip5Q8R361 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms