Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Hecw1Q8K4P8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms