Protein–RNA interactions for Protein: Q8K449

Abca9, ATP-binding cassette sub-family A member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca9Q8K449 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Abca9Q8K449 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abca9Q8K449 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abca9Q8K449 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abca9Q8K449 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abca9Q8K449 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abca9Q8K449 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abca9Q8K449 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abca9Q8K449 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abca9Q8K449 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abca9Q8K449 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abca9Q8K449 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abca9Q8K449 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abca9Q8K449 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abca9Q8K449 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abca9Q8K449 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
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