Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms