Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem17Q8K0U3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem17Q8K0U3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem17Q8K0U3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem17Q8K0U3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem17Q8K0U3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem17Q8K0U3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem17Q8K0U3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem17Q8K0U3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem17Q8K0U3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem17Q8K0U3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem17Q8K0U3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem17Q8K0U3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem17Q8K0U3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.4 ms