Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkn3Q8K045 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkn3Q8K045 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms