Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms