Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh13Q8CEE7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Rdh13Q8CEE7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Rdh13Q8CEE7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh13Q8CEE7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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