Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAI1

Ccdc142, Coiled-coil domain-containing protein 142, mousemouse

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Length 738 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc142Q8CAI1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc142Q8CAI1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc142Q8CAI1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc142Q8CAI1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc142Q8CAI1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc142Q8CAI1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc142Q8CAI1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc142Q8CAI1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc142Q8CAI1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc142Q8CAI1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc142Q8CAI1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc142Q8CAI1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc142Q8CAI1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc142Q8CAI1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc142Q8CAI1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc142Q8CAI1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc142Q8CAI1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc142Q8CAI1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc142Q8CAI1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc142Q8CAI1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc142Q8CAI1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc142Q8CAI1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc142Q8CAI1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc142Q8CAI1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc142Q8CAI1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc142Q8CAI1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc142Q8CAI1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc142Q8CAI1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc142Q8CAI1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc142Q8CAI1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc142Q8CAI1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc142Q8CAI1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc142Q8CAI1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc142Q8CAI1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc142Q8CAI1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc142Q8CAI1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc142Q8CAI1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc142Q8CAI1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc142Q8CAI1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
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