Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Strip1Q8C079 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms