Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms