Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
5730596B20RikQ8BQ08 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms