Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Tnrc6bQ8BKI2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnrc6bQ8BKI2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms