Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trmt12Q8BG71 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trmt12Q8BG71 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trmt12Q8BG71 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trmt12Q8BG71 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt12Q8BG71 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt12Q8BG71 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt12Q8BG71 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt12Q8BG71 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt12Q8BG71 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt12Q8BG71 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt12Q8BG71 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt12Q8BG71 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt12Q8BG71 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt12Q8BG71 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt12Q8BG71 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt12Q8BG71 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trmt12Q8BG71 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trmt12Q8BG71 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trmt12Q8BG71 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trmt12Q8BG71 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trmt12Q8BG71 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trmt12Q8BG71 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trmt12Q8BG71 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trmt12Q8BG71 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trmt12Q8BG71 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trmt12Q8BG71 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms