Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFV3

Dusp4, Dual specificity protein phosphatase 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp4Q8BFV3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dusp4Q8BFV3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Dusp4Q8BFV3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dusp4Q8BFV3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dusp4Q8BFV3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dusp4Q8BFV3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dusp4Q8BFV3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dusp4Q8BFV3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dusp4Q8BFV3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dusp4Q8BFV3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dusp4Q8BFV3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dusp4Q8BFV3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dusp4Q8BFV3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dusp4Q8BFV3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms