Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg4cQ811C2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms