Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zbed4Q80WQ9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed4Q80WQ9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms