Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnupnQ80W37 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnupnQ80W37 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SnupnQ80W37 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnupnQ80W37 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnupnQ80W37 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnupnQ80W37 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnupnQ80W37 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnupnQ80W37 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnupnQ80W37 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnupnQ80W37 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnupnQ80W37 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SnupnQ80W37 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnupnQ80W37 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnupnQ80W37 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnupnQ80W37 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnupnQ80W37 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnupnQ80W37 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnupnQ80W37 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnupnQ80W37 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms