Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Avl9Q80U56 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Avl9Q80U56 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms