Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cdc42bpbQ7TT50 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdc42bpbQ7TT50 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms