Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actn1Q7TPR4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actn1Q7TPR4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms