Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpf1Q7TND5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpf1Q7TND5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms