Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sbno2Q7TNB8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sbno2Q7TNB8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms