Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim12Q78RX3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim12Q78RX3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms