Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Syne2Q6ZWQ0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms