Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp34Q6ZQ93 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Usp34Q6ZQ93 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
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Usp34Q6ZQ93 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp34Q6ZQ93 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
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Usp34Q6ZQ93 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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Usp34Q6ZQ93 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Usp34Q6ZQ93 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp34Q6ZQ93 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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