Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dtx4Q6PDK8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Dtx4Q6PDK8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms