Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8I4

Pcnp, PEST proteolytic signal-containing nuclear protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnpQ6P8I4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnpQ6P8I4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnpQ6P8I4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms