Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6J4

Alkbh2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh2Q6P6J4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh2Q6P6J4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms