Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.08■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.07■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms