Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pram1Q6BCL1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pram1Q6BCL1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pram1Q6BCL1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pram1Q6BCL1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pram1Q6BCL1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pram1Q6BCL1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pram1Q6BCL1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pram1Q6BCL1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pram1Q6BCL1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pram1Q6BCL1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pram1Q6BCL1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pram1Q6BCL1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pram1Q6BCL1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pram1Q6BCL1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pram1Q6BCL1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pram1Q6BCL1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pram1Q6BCL1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pram1Q6BCL1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pram1Q6BCL1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms