Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rftn1Q6A0D4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rftn1Q6A0D4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms