Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Thsd7aQ69ZU6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Thsd7aQ69ZU6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms