Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CltcQ68FD5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CltcQ68FD5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CltcQ68FD5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms