Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gli3Q61602 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gli3Q61602 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms