Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
JrkQ60976 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
JrkQ60976 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
JrkQ60976 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
JrkQ60976 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
JrkQ60976 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
JrkQ60976 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
JrkQ60976 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
JrkQ60976 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
JrkQ60976 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
JrkQ60976 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
JrkQ60976 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
JrkQ60976 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
JrkQ60976 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
JrkQ60976 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
JrkQ60976 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms